昌吉有西马检查站，位于第六师芳草湖农场。西马检查站是新湖农场通往乌鲁木齐市、昌吉、石河子和内地省份的南大门，承担着农场外防输入的重任。昌吉回族自治州，简称昌吉州，是新疆维吾尔自治区辖自治州。新疆昌吉回族自治州曾是古代丝绸之路新北道通往中亚、欧洲的必经之路，自古为西域咽喉、北疆屏障，是新疆丝绸之路经济带核心区的重要组成部分。北疆铁路、312国道、216国道、115省道、吐乌大高等级公路贯穿全境。同时，昌吉州还是中小企业知识产权战略推进工程试点城市。2019年，入选国家农产品安全质量市名单。