等电点与电荷量之间没有直接的关系，等电点是指在一个电势场中，电荷的位置，而电荷量则是指电荷的数量。电荷量会影响电势场的强度，但是不会影响等电点的位置。等电点是一个分子表面不带电荷时的pH值，是针对带电荷的物质而言，不只限于两性电解质如氨基酸和蛋白质。

各种蛋白质因氨基酸残基组成不同，等电点也不一样。当溶液在某一特定pH值的条件下，蛋白质所带正电荷与负电荷恰好相等（总净电荷为零）时，在电场中既不向阳极移动，也不向阴极移动。因此利用电泳的方法可以确定蛋白质的等电点，也可将不同带电性质和不同大小、形状的蛋白质分子进行分离纯化。